Sau khi chế độ bạo chúa bị lật đổ, các thủ lĩnh đối địch trong chính trường là Isagoras, con trai của Tisander và là một kẻ theo phe bạo chúa, cùng với Cleisthenes, thuộc gia tộc Alcmeonidae. Cleisthenes, khi thất thế trong các câu lạc bộ chính trị, bèn kêu gọi nhân dân bằng cách trao quyền bầu cử cho quần chúng. Do đó, Isagoras thấy lực lượng của mình yếu thế hơn, liền mời Cleomenes — người có mối thâm tình khách gia với ông — quay lại Athens, đồng thời thuyết phục vị vua này "tẩy trừ vết nhơ", một cái cớ bắt nguồn từ việc gia tộc Alcmeonidae bị cho là đang gánh chịu lời nguyền bất tịnh. Trước tình hình đó, Cleisthenes đã rời khỏi đất nước, còn Cleomenes dẫn một lực lượng nhỏ tiến vào xứ Attica và trục xuất bảy trăm gia đình Athen với cáo buộc ô uế. Làm xong việc này, ông ta lại mưu tính giải tán Hội đồng, rồi tôn Isagoras cùng ba trăm đồng lên nắm quyền tối cao trong nhà nước. Thế nhưng, Hội đồng đã đứng lên chống lại, dân chúng tụ tập đông đảo, khiến Cleomenes, Isagoras và phe cánh của họ phải chạy trốn vào Thành Acropolis. Tại đây, người dân bao vây họ trong hai ngày; đến ngày thứ ba, đôi bên thỏa thuận để Cleomenes cùng toàn bộ tùy tùng rút lui, đồng thời triệu hồi Cleisthenes cùng những kẻ lưu vong khác trở về Athens.

Khi nhân dân đã nắm quyền cai quản sự nghiệp đất nước như vậy, Cleisthenes trở thành thủ lĩnh tối cao và là người lãnh đạo quần chúng của họ. Điều này cũng dễ hiểu; bởi vì gia tộc Alcmeonidae có lẽ là nguyên nhân chính dẫn đến việc trục xuất các bạo chúa, và trong phần lớn thời gian cai trị của chúng, họ luôn ở trong tình trạng chiến tranh không dứt với chúng. Thế nhưng, ngay cả trước những nỗ lực của nhà Alcmeonidae, một người tên là Cedon từng mở cuộc tấn công chống lại các bạo chúa; nhân sự kiện ấy, một bài ca uống rượu phổ biến khác đã ra đời, hướng về ông:

Này chàng trai, hãy rót thêm chén rượu mừng dâng Cedon, chớ quên phận sự này,

Nếu lời chúc tụng thực xứng đáng với một người chính trực và ngay thẳng đây.