Vào thời điểm then chốt này, khi quân Macedonia còn đang nghi ngại về kết cục của trận chiến, Parmenio vội vã phái người đưa tin đến chỗ Alexander, báo rằng cánh quân của ông đang ở thế nguy nan và cần viện trợ. Khi tin tức này đến tai Alexander, ông lập tức dừng cuộc truy đuổi, quay đầu cùng kỵ binh Companion, nhanh chóng tiến về phía cánh phải của quân ngoại bang. Đầu tiên, ông tấn công vào lực lượng kỵ binh đang tháo chạy của kẻ thù, gồm quân Parthia, một số quân Ấn Độ, cùng phân đội đông đảo và dũng mãnh nhất của người Ba Tư. Thế rồi, một trận kỵ chiến khốc liệt nhất đã diễn ra. Bởi vì được dàn trận theo từng đội kỵ binh, quân ngoại bang quay lại, giáp lá cà với quân của Alexander; họ không còn cậy nhờ vào việc phóng lao hay phô diễn kỹ nghệ điều khiển ngựa như thông thường trong các trận chiến kỵ binh, mà mỗi người đều gắng sức xông pha hòng phá vỡ những gì cản đường, như thể đó là cơ hội sống sót duy nhất. Họ chém giết và bị chém giết không khoan nhượng, như thể không còn chiến đấu để giành thắng lợi cho bất kỳ ai nữa, mà là vì mạng sống của chính mình. Tại đây, khoảng sáu mươi quân Companion của Alexander đã tử trận; Hephaestion cùng Coenus và Menidas đều bị thương. Thế nhưng, Alexander vẫn đánh bại những đội quân này; những kẻ còn sống sót sau khi cố gắng phá vỡ hàng ngũ của ông đã tháo chạy hết tốc lực.

Lúc bấy giờ, Alexander suýt nữa đã chạm trán với cánh phải của quân địch, nhưng cùng lúc đó, kỵ binh Thessaly đã có một màn giao tranh huy hoàng, không hề kém cạnh với thành quả của Alexander trong trận đánh. Khi ông đến nơi, quân ngoại bang ở cánh phải đã bắt đầu rút chạy; vì vậy, ông lại quay đầu và tiếp tục truy đuổi Darius một lần nữa, cuộc rượt đuổi kéo dài chừng nào ánh sáng ban ngày còn sót lại. Lữ đoàn của Parmenio cũng theo sát những kẻ đối đầu với họ. Nhưng Alexander đã vượt sông Lycus và đóng trại tại đó để cho người và ngựa nghỉ ngơi đôi chút; trong khi Parmenio chiếm được trại của người Ba Tư cùng với hành lý, voi và lạc đà của họ. Sau khi cho kỵ binh nghỉ ngơi đến nửa đêm, Alexander lại hành quân thần tốc hướng về Arbela, với hy vọng bắt sống Darius, cùng với tiền bạc và phần còn lại trong tài sản hoàng gia của hắn.

Ông đến Arbela vào ngày hôm sau, sau khi đã truy đuổi một quãng đường tổng cộng khoảng 600 stade từ chiến trường. Nhưng vì Darius tiếp tục chạy trốn mà không dừng nghỉ, ông đã không tìm thấy hắn tại Arbela. Tuy nhiên, tiền bạc và tất cả các tài sản khác đều đã bị chiếm giữ, cùng với cỗ xe của Darius. Ngọn giáo và cây cung của hắn cũng bị lấy đi, giống như những gì đã xảy ra sau trận Issus. Về phía quân của Alexander, khoảng 100 người tử trận, và hơn 1.000 con ngựa bị mất do vết thương hoặc kiệt sức trong cuộc truy đuổi, gần một nửa trong số đó thuộc về kỵ binh Companion. Người ta nói rằng có khoảng 300.000 quân ngoại bang bị giết, và số người bị bắt làm tù binh còn nhiều hơn thế. Những con voi và tất cả các cỗ xe không bị phá hủy trong trận chiến cũng đều bị chiếm lấy.

Kết cục của trận đánh, diễn ra vào thời kỳ chấp chính quan Aristophanes tại Athens, vào tháng Pyanepsion, là như vậy; và nhờ đó, lời tiên tri của Aristander đã được ứng nghiệm, rằng Alexander sẽ vừa chiến đấu vừa giành thắng lợi trong cùng một tháng mà nguyệt thực xuất hiện.